Genômica comparativa em Leishmania spp.: identificação de marcadores evolutivos e novos alvos terapêuticos
Palavras-chave:
Genômica Comparativa, Leishmania, BioinformáticaResumo
INTRODUÇÃO
As leishmanioses representam um grave problema de saúde pública na Amazônia, onde a diversidade de espécies e as limitações terapêuticas dificultam o controle da doença. A conservação genômica em Leishmania possibilita identificar vulnerabilidades biológicas e alvos de amplo espectro1. Este estudo analisou a arquitetura genômica de sete espécies neotropicais de Leishmania via genômica comparativa, visando mapear regiões conservadas e alvos terapêuticos.
METODOLOGIA
Dados Illumina de nove isolados (L. amazonensis, L. infantum, L. braziliensis, L. guyanensis, L. shawi, L. naiffi e L. lainsoni) foram montados de novo (MEGAHIT) e filtrados (BLASTn). A reconstrução cromossômica e sintenia deu-se com ABACAS e MUMmer4 (L. major como referência). A anotação empregou software AUGUSTUS e o pangenoma foi inferido com GET_HOMOLOGUES2. Dados do core-genome foram cruzados com um banco personalizado de alvos farmacêuticos para priorização de proteínas conservadas.
RESULTADOS E DISCUSSÃO
As montagens geraram 29,4–33,7 Mbp e 7.522–7.793 genes. O teor de GC (57,15%–57,71%) em L. (Viannia) e (59,38%–59,59%) em L. (Leishmania) atuou como marcador taxonômico estável. A sintenia revelou conservação e fusões distintas (20+34 em L. (Viannia); 20+36 e 8+29 em L. amazonensis). Mapearam-se 9.964 grupos ortólogos, sendo 6.256 universais (core-genome), indicando pangenoma aberto3. Priorizaram-se seis alvos promissores: NTMT1, MPK10, BDF2, PdxK, BDF5 e TKUL.
CONSIDERAÇÕES FINAIS
A abordagem pangenômica mapeou a diversidade evolutiva de Leishmania e identificou possíveis alvos terapêuticos conservados no core-genome, fornecendo subsídios para o desenvolvimento de novos fármacos.
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