Desenvolvimento de um painel de tag-SNPs para alelos HLA associados a RAM em Belém, Pará

Resumen

INTRODUÇÃO
A farmacogenética é interessada nos alelos HLA devido a sua interação com medicamentos específicos que podem ocasionar Reações Adversas a Medicamentos (RAM)3. A genotipagem por TAG-SNP é uma alternativa para identificação desses alelos de forma menos custosa¹. O objetivo do presente estudo é identificar, validar e desenvolver um painel de SNPs que possam ser usados para genotipar alelos HLA que foram identificados na literatura como associados RAM, para possibilitar uma alternativa de genotipagem menos custosa.

METODOLOGIA
Foi realizado um estudo transversal do tipo de teste de acurácia. Foi realizado uma busca no NCBI para encontrar os TAG-SNPs dos alelos HLA, e o PharmGKB para identificar os alelos HLA associados a RAM^1,2,3. Então foi realizado uma busca no GWAS, realizada pelo grupo LGDC da UFPA, em 580 indivíduos da região metropolitana de Belém para identificar quais dos potenciais TAG-SNPs estavam presentes e a frequência dos alelos HLA alvos para calcular os parâmetros de Sensibilidade, Especificidade, PPV e NPV de cada SNP com o seu alvo para validá-los como TAG-SNPs na população local.

RESULTADOS E DISCUSSÃO

Foram identificados 237 alelos e 35 desses apresentam parâmetros suficientes para serem utilizados como alternativas de genotipagem indireta, sendo que os 18 melhores apresentam Sensibilidade e Especificidade ≥95 e 90%, respectivamente. Polimorfismos como o rs2499, TAG-SNP do HLA-A*03:01, associado com RAM ao fazer uso de fenitoína, está em perfeito desequilíbrio de ligação, e o rs2395029, TAG-SNP do HLA-B*57:01, associado com RAM ao fazer uso de abacavir, que apresenta valores dos parâmetros próximos à 100%. Foi elaborado um painel para 31 medicamentos associados a RAM na presença de alelos HLA que possuam alelos TAG-SNP capazes de identificá-los com alta confiabilidade. O painel foi montado para a população de Belém com os 35 SNPs validados.

CONSIDERAÇÕES FINAIS

Os SNPs com altos parâmetros têm potencial de mudar a avaliação médica, identificando previamente indivíduos em risco de RAM, sendo necessário estudos com populações maiores.